月季DEADbox RNA解旋酶家族全基因组鉴定与表达分析

来源：江苏农业科学杂志2026年第第8期北京时间：

作者：李颖;郭文涛;段高飞;王艺霖;许瑞瑞

单位：潍坊学院生物与海洋学院，山东潍坊 261061

摘要：DEAD-box型RNA解旋酶作为最大的一类RNA解旋酶蛋白质亚家族，除具有RNA代谢调控功能外，还广泛参与了植物的生长发育和非生物胁迫响应。通过对月季全基因组的鉴定，筛选出40个DEAD-box RNA(DDX)解旋酶基因家族成员。利用生物信息学方法对月季DEAD-box RNA解旋酶基因家族进行系统的理化性质、染色体定位、共线性、系统进化树、顺式作用元件及基因表达模式等分析。结果表明，RcDEAD家族成员的蛋白序列长度为 411~1 138 aa，分子量为46.71~129.29 ku，等电点为5.07~10.00。大部分成员定位于细胞核，少部分成员定位于细胞质、叶绿体中。RcDEAD集中分布在7条染色体上，其中2号染色体分布数目最多。RcDEAD家族包含2个串联重复基因对及存在3对共线性关系的基因。所有家族成员均含有8个保守基序，且motif4(基序Ⅱ)中DEAD序列保守性达100%。25个RcDEAD成员含有SrmB结构域，15个RcDEAD成员含有DEADc结构域。系统进化树将RcDEAD成员分为6个亚组，其Group Ⅵ数量最多(占比44.28%)。月季DEAD解旋酶家族与烟草、拟南芥的进化关系最近，其次是小麦。共线性分析结果表明，月季与沙梨、枇杷、苹果之间存在较多的同源基因。顺式作用元件分析发现，RcDEAD家族成员启动子区分布大量光、激素、非生物胁迫响应等相关元件。组织表达模式分析结果显示，RcDEAD成员在根、茎、叶和皮刺中有不同程度的表达。干旱胁迫诱导表达分析结果表明，在根中有9个RcDEAD成员表达上调，20个成员表达下调；在叶片中有23个RcDEAD成员表达上调，11个成员表达下调。

关键词：DEAD-box RNA解旋酶;月季;生物信息学;表达分析