《江苏农业科学杂志》发表论文赏析
作者:陆红臣;刘陈玮;王凡;卞晓春;徐仁超;吴春芳
单位:江苏沿江地区农业科学研究所,江苏南通 226012
摘要:在蚕豆中克隆开花信号整合因子SOC1,分析其编码蛋白的理化特性,明确该基因的组织表达特性并初步探究其在蚕豆非生物胁迫应答中的潜在功能,以期为蚕豆花期调控以及抗逆育种提供理论依据。研究以拟南芥SOC1蛋白序列为检索模板,通过本地BLAST获得候选基因VfSOC1(ID:Vfaba.Tiffany.R1.4g112200.1)的编码序列;以蚕豆品种通鲜2号混合组织cDNA为模板,设计特异性引物通过PCR扩增、测序后获得VfSOC1编码区序列;利用多种生物信息学工具对VfSOC1的蛋白特性、保守结构域、启动子顺式调控元件及蛋白互作网络进行系统性分析;采用实时荧光定量PCR对VfSOC1在蚕豆多个组织(根、茎、叶、蕾、荚果等)及非生物胁迫(干旱胁迫、盐胁迫、低温胁迫)和激素(脱落酸、茉莉酸甲酯)下的表达水平进行分析。结果表明,VfSOC1 CDS长度为627 bp,编码208个氨基酸,蛋白分子量为24.21 ku,预测等电点为7.53,平均亲水性系数为-0.71,无跨膜结构域,属于不稳定的亲水核蛋白;VfSOC1含有MADS_MEF2_like和K-box结构域,属于MADS-box家族成员;启动子分析揭示VfSOC1含有G-box、ABRE等顺式元件,可响应光周期、激素及逆境胁迫;系统进化分析表明其与豌豆(85.99%)、苜蓿(75.60%)亲缘关系最近;表达分析显示VfSOC1在叶片、荚果和种子中高表达,且显著响应干旱(6 h峰值)、盐胁迫(1 h诱导)、脱落酸(12 h 响应)及低温(30 d积累);蛋白互作网络预测其与开花调控核心蛋白(LFY、FRI、VRN2等)存在互作。上述结果表明:VfSOC1是蚕豆中1个典型的MADS-box家族基因,参与多种逆境胁迫响应,可能通过整合春化信号及激素通路在花期调控中起核心作用,是具备多功能潜力的候选基因,可用于后续转基因功能验证与分子育种研究。
关键词:蚕豆;VfSOC1'VfSOC1;克隆;非生物胁迫;表达分析