基于BSA重测序的花生侧枝生长习性基因定位

来源：江苏农业科学杂志2026年第第7期北京时间：

作者：郭敏杰;邓丽;殷君华;苗建利;任丽

单位：开封市农林科学研究院，河南开封 475000

摘要：对控制花生侧枝生长习性的基因进行初定位，有助于研究花生倒伏性、结荚特性，为花生株型遗传改良及品种种植模式研究提供理论支撑。以匍匐型花生品种Tifrunner和直立型品种开农616为亲本构建的F2代群体为材料，利用集群分离分析法(BSA)对双亲及极端池共4个样本进行重测序，通过ΔSNP-index/ΔInDel-index算法，获得控制侧枝生长习性基因的候选区间和位点，对候选基因进行功能注释。杂交组合(Tifrunner×开农616) F1代均为半匍匐型，获得包含376个单株的F2代群体。质控后获得149 467个变异位点，包含127 806个SNP和21 661个InDel，二者均在A03号染色体上分布最多，B02号染色体上分布最少。通过Δ(SNP_index)值算法获得全基因组内B05号染色体上的2个关联区间36.73~39.35、150.83~159.40 Mb，长度分别为2.62、8.57 Mb，前者区间内无大效应变异位点，后者区间内有11个SNP和2个Indel位于基因的外显子上，其中5个SNP引起了非同义突变、1个SNP造成终止突变、2个Indel引起了插入移码突变。经注释共获得7个候选基因，涉及MADS-box转录因子、F-box结构域的蛋白、1-氨基环丙烷-1-羧酸氧化酶等。初步将控制花生侧枝生长习性的基因定位在B05染色体的8.57 Mb区段内，可为花生理想株型育种提供理论支持。

关键词：花生;侧枝生长习性;BSA;分子标记;定位;候选基因