菊花HSF基因家族鉴定及表达分析

来源：江苏农业科学杂志2026年第第5期北京时间：

作者：李会云;司润;王雪;钟敏;张延召;程彦伟;郭雪

单位：洛阳师范学院生命科学学院，河南洛阳 471000

摘要：对菊花热休克转录因子(HSF)家族进行鉴定与生物信息学分析，通过BLAST工具比对菊花HSF蛋白，借助NCBI CDD、InterPro与SMART等在线网站进一步筛选。运用多种工具进行分析：用Expasy-ProtParam分析理化性质；用MEGA 11.0构建进化树；用Cell-Ploc、TBTools等分析亚细胞定位、染色体定位、基因结构和保守基序，并预测基因上游顺式作用元件；利用TBTools和Excel 2016分析并可视化呈现HSF基因在菊花不同组织及不同胁迫条件下的表达情况。结果显示，鉴定出的101个菊花HSF基因家族成员多位于细胞核，少数在细胞质和叶绿体；氨基酸数量为105~487，相对分子质量为12 325.78~55 994.06 u，等电点为4.46~9.55；分为三大亚族，101个HSF基因不均匀地分布于27条染色体；启动子区域含多种诱导元件，家族成员均含HSF结构域；CmHSF-69和CmHSF-70在根、茎、管状花花瓣和管状花雌蕊中表达量较高；链格孢菌、堀柄锈菌等病菌侵染及褪黑素处理下多数候选基因表达上调，低温时CmHSF-69和CmHSF-70表达大幅下降。由此得出结论，菊花HSF家族101个成员可分为三大亚族，具有不同基因结构和表达模式，共同参与调控菊花生长发育。

关键词：生物信息学;菊花;HSF 基因家族;表达分析