苍术属植物叶绿体密码子偏好性分析

来源：江苏农业科学杂志2026年第第3期北京时间：

作者：何培;孙会改;荣正普;郑玉光;韩晓伟;裴林

单位：1.河北中医药大学第四附属医院，河北石家庄 050031； 2.河北中医药大学，河北石家庄 050200；3.河北化工医药职业技术学院，河北石家庄 050026

摘要：为探究苍术属药用植物叶绿体基因组基因密码子使用偏好性，以关苍术、苍术、白术、鄂西苍术叶绿体基因组的52条共有基因序列为材料，利用EMBOSS在线工具和CodonW1.4.2软件，统计各基因的有效密码子数、核苷酸百分比、同义密码子使用频率、密码子总GC含量及密码子3位GC含量(GC1、GC2、GCc3)，并通过PR2-plot分析、ENC-plot 分析和中性绘图分析，最终鉴定出最优密码子。结果表明，4种苍术属植物叶绿体基因组密码子偏好以 A/U 结尾。PR2-plot、中性绘图及ENC-plot分析结果显示，苍术属植物叶绿体基因组密码子使用偏好受突变压力与自然选择共同影响；共鉴定出5个最优密码子(UUA、UCU、ACU、GCU、UAA)，且最优密码子均以A/U 结尾。本研究揭示了苍术属密码子偏性形成的主要影响因素，为苍术属叶绿体基因组密码子优化、物种进化及遗传育种研究提供了支撑。

关键词：苍术属;密码子偏性;最优密码子;突变压力;自然选择