基于InDel标记的大球盖菇种质资源指纹图谱构建与遗传多样性分析

来源：江苏农业科学杂志2026年第第1期北京时间：

作者：付露琴; 郭俞彤; 王馨悦; 杨迎霞; 于海利; 钱磊; 班立桐

单位：1.天津农学院农学与资源环境学院，天津 300392；2.天津市农业科学院种质资源与生物技术研究所，天津 300381； 3.武威市农业科学研究院，甘肃武威 733000

摘要：为探究大球盖菇种质资源的遗传多样性并明确大球盖菇品种的亲缘关系，收集来自我国不同地区的20个大球盖菇品种，利用InDel分子标记技术进行遗传多样性分析，并构建指纹图谱。基于4个大球盖菇菌株的全基因组重测序数据，通过生物信息学分析，筛选出插入/缺失碱基数大于25 bp的InDel位点，并利用37对InDel引物对20个大球盖菇菌株的基因组DNA进行PCR扩增，最终筛选出7个多态性显著且扩增效果最优的InDel标记。以这7对InDel引物组合构建12个大球盖菇菌株的数字指纹图谱，能有效区分不同大球盖菇的基因型。采用NTSYSpc 2.1软件对电泳后的多态性条带进行聚类分析，UPGMA聚类分析结果显示，20个大球盖菇菌株间的遗传相似系数介于 0.35~1.00之间；在遗传相似性系数为0.57时，所有菌株可被分为3个类群，其中第Ⅰ类群包含16个菌株，第Ⅱ类群包含3个菌株，第Ⅲ类群包含1个菌株。表明开发的InDel标记能够准确、快速地区分与鉴定不同大球盖菇品种，同时揭示了其种质资源之间的遗传多样性，为大球盖菇的遗传育种及品种鉴定提供重要的理论依据和技术支持。

关键词：大球盖菇;不同品种;全基因组重测序;InDel标记;遗传多样性分析