《计算机应用与软件杂志》发表论文赏析
作者:祁枢杰,陆卫忠,傅启明,马洁明,崔志明,吴宏杰, , , , ,
摘要:DNA结合蛋白的研究在生物制药、临床检验领域有着重要的意义和作用。深度学习方法显著提高了预测精度,但是在利用蛋白结构和进化信息时遇到了瓶颈。为此,提出一种基于双通道混合图神经网络的DNA结合蛋白识别方法,利用序列比对发现序列进化信息,融合图注意力网络和图同构神经网络,分别挖掘蛋白质接触图和序列进化中蕴藏的DNA结合蛋白的关键信息,并得到高精度的蛋白质的表示。实验结果表明,该方法在独立测试集上与6种典型方法的平均准确率相比提高了9.49%。
关键词:DNA结合蛋白, 图注意力网络, 蛋白质接触图, 图同构神经网络, 序列预处理