《计算机应用杂志》发表论文赏析

基于申威众核处理器的混合并行遗传算法

来源:计算机应用杂志2017年第9期北京时间:

作者:赵瑞祥, 郑凯, 刘垚, 王肃, 刘艳, 沈焕学, 周谦豪

单位:1. 华东师范大学 计算机科学与软件工程学院, 上海 200062;2. 数学工程与先进计算国家重点实验室, 江苏 无锡 214215;3. 华东师范大学 经济与管理学部, 上海 200062

摘要:传统遗传算法求解计算密集型任务时,适应度函数的执行时间增加相当快,致使当种群规模或者进化代数增大时,算法的收敛速度非常缓慢。基于此,设计了"粗粒度-主从式"混合式并行遗传算法(HBPGA),并在目前TOP500上排名第一的超级计算机神威"太湖之光"平台上实现。该算法模型采用两级并行架构,结合了MPI和Athread两种编程模型,与传统在单核或者一级并行构架的多核集群上实现的遗传算法相比,在申威众核处理器上实现了二级并行,并得到了更好的性能和更高的加速比。实验中,当从核数为16×64时,最大加速比达到544,从核加速比超过31。

关键词:混合并行遗传算法,神威太湖之光,众核,MPI,Athread

基金资助:数学工程与先进计算国家重点实验室开放基金资助项目(2016A05)。

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