基于特征加权的蛋白质交互识别
来源：计算机技术与发展杂志2016年第02期北京时间：
作者：吴红梅;牛耘
摘要：在以单词为特征的模型中,如果特征单词在不同类别中的使用情况存在明显差异,那么它对分类有着很重要的影响。因此文中基于大规模语料库,研究不同的特征加权方法对PPI识别的影响。首先,通过搜索医学文献数据库建立蛋白质对的签名档,以单词作为描述蛋白质对关系的特征,构建向量空间模型；然后,选择不同的加权方法描述单词重要性；最后,以K近邻和SVM分类方法构建分类器判断蛋白质对是否存在交互关系。实验结果表明,根据特征向量单词的重要性进行加权,PPI识别精确度、召回率和准确率有了明显的提高。
关键词：蛋白质交互;大规模语料;特征加权;K近邻;支持向量机
