基于重映射的 SPRI 视频自动找点方法

来源：计算机技术与发展杂志2021年第08期北京时间：

作者：袁彬峰;汪之又;黄彩霞;罗宇

单位：1. 国防科技大学 计算机学院,湖南 长沙 410073;2. 长沙学院 电子信息与电气工程学院,湖南 长沙 410022;3. 长沙学院 计算机工程与应用数学学院,湖南 长沙 410022

摘要：表面等离子共振成像(SPRI)是一种高灵敏度,高通量的,可用于实时分析生物蛋白间的相互作用的新技术。 由于高通量,不需要额外标记等优点,该技术广泛应用于药物筛选、食品检测、环境监测等领域。 实现 SPRI 视频自动化分析的关键是自动定位 SPRI 视频图像中的蛋白阵列,为解决该问题提出了基于重映射的 SPRI 视频自动找点的算法。 算法需要输入生物芯片的打印效果图和 SPRI 视频图像,处理过程分为六个部分:截取,边缘检测,椭圆拟合,阵列识别,坐标映射和自动校准,输出 SPRI 视频中蛋白点阵列的坐标矩阵。 算法基于将打印效果图中的蛋白点坐标重映射为 SPRI 视频中蛋白点坐标思路实现。 实验结果表明,该算法能准确定位 SPRI 视频中的蛋白阵列,不受蛋白点的阵列模式和 SPRI 视频中噪音的影响。 并且算法定位 SPRI 视频中蛋白阵列耗时短,支持在嵌入式设备上实时分析 SPRI 视频.

关键词：表面等离子共振成像;图像处理;重映射;蛋白质微阵列;嵌入式