一种兼具生物和物理特征的E基因签名方法#br# ——以p53家族基因为例

来源：计算机工程与应用杂志2017年第13期北京时间：

作者：蔡 蓉，钱 东，王丹丹，朱 平

单位：江南大学 理学院，江苏 无锡 214122

摘要：在原来的具有生物特性的基因签名方法上，引入具有一定的物理特性的核苷酸游离电子的平均能量（EIIP），建立了一种新的E基因签名方法。定义了两序列间的E欧氏距离及[e]均方差公式，并对相关物种进行层次聚类分析。通过对20个物种的p53家族基因mRNA完整的CDS序列进行E基因签名得出，在每种基因中均有，物种关系越近，其基因签名相似度越高。将聚类结果与原来的基因签名方法的聚类结果作对比，发现了E基因签名方法更准确，从而更有利于深入了解p53家族基因的性质。

关键词：p53家族基因,基因签名,核苷酸游离电子的平均能量（EIIP）,层次聚类分析