《计算机工程与应用杂志》发表论文赏析

采用多样性选择的量子粒子群双向聚类算法

来源:计算机工程与应用杂志2018年第9期北京时间:

作者:陈佳瑜,李 梁,罗 云

单位:重庆理工大学 计算机科学与工程学院,重庆 400054

摘要:双向聚类已成为分析基因表达数据的一种重要工具,可以同时从基因和条件两个方向寻找具有相同表达波动的簇。但双向聚类是一种多目标优化的局部搜索算法,处理繁杂的基因数据时容易陷入局部最优。为提高算法的全局搜索能力,提出了一种多样性选择的量子粒子群双向聚类算法(Diversify-Optional QPSO,DOQPSO)。算法首先采用DOQPSO处理基因数据,然后用改进的FLOC算法进行贪心迭代寻找双向聚类,以求得更为理想的结果。算法通过实验仿真,并与FLOC算法和QPSO算法进行比较,结果证明DOQPSO双向聚类算法具有更好的全局寻优能力,且聚类效果更佳。

关键词:双向聚类,基因表达数据,量子粒子群算法,多样性选择,FLOC算法

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