基因沉默机制的基因表达式编程

来源：计算机工程与应用杂志2018年第23期北京时间：

作者：郭 勇1，张国锋1，刘丽萍2

单位：1.黔南民族师范学院 计算机与信息学院，贵州 都匀 558000 ；2.黔南民族师范学院 生命科学与农学院，贵州 都匀 558000

摘要：基因表达式编程（Gene Expression Programming，GEP）对多项式函数为目标的符号回归问题计算效果良好，而对包含多种运算目数、非多项式函数的计算效果欠佳。受转基因生物工程中基因沉默现象的启发，提出一种GEP拓展算法SFGEP（Gene Expression Programming of Symbol Field，SFGEP）。SFGEP染色体由表达因子域与表达基因域组成，按“深度优先”原则解释染色体，利用不同操作符目数，形成基因表达的抑制因子和位置效应，实现染色体解释中基因沉默的机制。实验结果表明，相较传统多基因染色体GEP，SFGEP既保持了一定多项式函数挖掘的能力，又在包含不同运算目数操作符的非多项式函数挖掘方面具有更好的效能，SFGEP的成功率更高、收敛速度更快。

关键词：基因表达式编程,染色体,基因沉默,符号回归,多样性