药物-靶点相互作用预测的计算方法综述

来源：计算机工程与应用杂志2023年第12期北京时间：

作者：张然, 王学志, 汪嘉葭, 孟珍

单位：1.中国科学院 计算机网络信息中心 大数据技术与应用发展部，北京 100083；2.中国科学院大学 计算机科学与技术学院，北京 100049

摘要：药物-靶点相互作用预测旨在发现可作用于特定蛋白质的潜在药物，在药物重定位、药物副作用预测、多重药理学和耐药性的研究中都发挥着重要作用。随着计算机处理能力的进步和计算算法的不断更新，药物-靶点相互作用预测的计算方法展现出时间短、成本低、精度高、范围广的优势，受到了广泛的关注，并取得了显著的进展。为了梳理其研究发展历程，探讨未来的研究方向，就药物-靶点相互作用预测的背景和意义进行简要概述；将方法分为基于分子对接、基于药物结构、基于文本挖掘和基于化学基因组四类进行综述，并对每类方法进行对比分析，详细阐述每类方法的数据需求及应用场景；对现有研究存在的局限性和面临的挑战进行讨论，展望未来的研究方向，为后续研究提供参考和借鉴。

关键词：药物-靶点相互作用预测,药物发现,数据挖掘,生物信息