基于最长控制链的基因调控网络可控性研究
来源：计算机工程杂志2018年第11期北京时间：
作者：白雪一,郭炳晖,李佳辉,郑志明
单位：北京航空航天大学 a.数学、信息与行为教育部重点实验室; b.大数据科学与脑机智能高精尖创新中心,北京 100191
摘要：为分析基因调控网络的可控性,以人类细胞周期中的基因调控网络为研究对象,通过布尔逻辑函数描述基因间的关联关系,根据基因状态对基因网络的结构控制过程进行分类重构。在此基础上,利用最长控制链方法探索基因调控路径,并与极大匹配算法得到的结果进行对比。实验结果表明:控制基因网络的能量,与控制由3个节点基因CyclinD1、Myc、RB组成的链式网络的能量为同一数量级;当基因E2F1处于激活状态时,基因Myc决定控制网络的能量。
关键词：基因调控网络, 最长控制链, 网络可控性, 布尔网络, 极大匹配, 能量
基金资助：国家自然科学基金(11401017,11671025);国家自然科学基金重大项目(11290141)。
