数字PCR和下一代测序方法用于KRAS基因突变检测中的可比性研究

来源：计量学报杂志2018年第3期北京时间：

作者：董莲华,王晶,傅博强,段宇航,隋志伟

单位：中国计量科学研究院, 北京 100029

摘要：针对KRAS基因中的2个常见突变G12R和G12S,建立了基于数字聚合酶链反应（PCR）和下一代测序（NGS）技术的特异性检测方法。利用含有目标突变的细胞系配制成不同突变比例的样本,考察了所建立的数字PCR和NGS方法的分析灵敏度和2种方法测量结果的可比性。结果发现对突变比例≥0.83%的样品,NGS和数字PCR的测定结果无显著差异（p>0.05）。突变比例<0.83%的样品,2种方法的测定结果差异显著（p<0.05）,而数字PCR方法的测定结果与配制值无显著差异。这表明2种方法在检测高丰度突变时测量结果可比,而数字PCR方法在测定低丰度突变时准确性更高。

关键词：计量学; 肿瘤标志物; KRAS; 聚合酶链反应; 下一代测序; 基因突变

基金资助：国家重点研发计划（2016YFC1000301-3）;公益行业专项（AHY1504）;中国计量科学研究院基本业务费（AKY1612）