《吉林大学学报·理学版杂志》发表论文赏析

AP数据源融合算法构建基因调控网络

来源:吉林大学学报·理学版杂志2019年第5期北京时间:

作者:郑明, 刘桂霞, 卓慕瑰

单位:1. 梧州学院 广西高校行业软件技术重点实验室, 广西 梧州 543002;2.吉林大学 计算机科学与技术学院, 长春 130012

摘要:针对单一数据集构建基因调控网络算法数据量不足及构建网络结果不精确的问题, 提出一种基于能力与信任(AP)的数据源融合算法.该算法将基因表达数据、 蛋白质相互作用数据和基序数据集, 分别通过控制与被控制双向数据流传输来分析和构建基因调控网络, 并与ReMoDiscovery,CLR和C3Net三种已开发模型在酵母全基因组网络构建结果的AUC值进行对比. 对比结果表明, 该算法在构建基因调控网络算法方面执行效率更高、 收敛性更强.

关键词:AP算法,数据源融合,基因调控网络,全基因组关联

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