单细胞RNA-seq数据缺失元素补全算法
来源：吉林大学学报·理学版杂志2020年第5期北京时间：
作者：崔璐, 刘桂锋
单位：1. 吉林大学 中日联谊医院医疗保险管理部, 长春 130033; 2. 吉林大学 中日联谊医院放射线科, 长春 130033
摘要：基于非负矩阵分解模型, 提出一种新的数据补全算法. 该算法通过循环遍历确定最佳构造矩阵和rank值, 解决了单细胞转录组测序(RNA-seq)数据中存在缺失值的问题, 避免了由于单细胞测序深度不足对细胞分型分析的影响. 在慢性粒细胞白血病单细胞测序数据上的实验结果表明, 由补全算法恢复缺失值后的细胞分型更清晰, 验证了该算法的有效性.
关键词：单细胞RNA-seq数据,缺失元素,非负矩阵分解
