基于模体中心结构的蛋白质复合物识别算法

来源：吉林大学学报·理学版杂志2021年第6期北京时间：

作者：夏雪飞, 王铭杰, 吴佳楠

单位：1. 长春大学 量子信息实验室, 长春 130022； 2. 吉林交通职业技术学院 交通信息学院, 长春 130012

摘要：基于蛋白质相互作用的网络有明显模块化特征, 其对预测蛋白质功能、解释特定的生物进程具有重要作用, 网络模体是复杂网络演化的重要拓扑结构, 其代表了复杂系统中的重要功能单元, 具有进化保守性的特性, 提出一种新的基于网络模体为核心节点组的蛋白质复合物识别算法. 该算法根据蛋白质相互作用网络的拓扑特性, 将模体作为蛋白质复合物的中心结构体, 并基于中心结构体进行二层节点扩充, 能准确有效地识别蛋白质复合物.并且将复合物二维网络进行三维转化, 从而更直观清晰地展示复合物的结构体特征. 实验结果验证了该算法的有效性及可行性.

关键词：蛋白质相互作用网络,网络模体,蛋白质复合物,中心结构体