miR-499 基因家族进化分析及其对鸡骨骼肌肌纤维类型调控的研究

来源：家畜生态学报杂志2022年第12期北京时间：

作者：石诗影,巨晓军,屠云洁,单艳菊,姬改革,刘一帆,章明,束婧婷

单位：1. 江苏省家禽科学研究所/江苏省家禽遗传育种重点实验室，江苏 扬州 225125；2. 江苏省家禽科学研究所 科技创新有限公司，江苏 扬州 211412

摘要：为了对miR499进行序列进化分析、靶基因预测、鉴定和表达量分析，探究其对鸡骨骼肌肌纤维类型的具体调控作用，在miRBase数据库检索miR499基因家族的序列，利用ClustalX软件对序列特征进行分析，采用MEGA7.0构建miR499系统发育树，再利用生物信息学工具进行靶基因预测和功能富集，最后通过荧光定量PCR和双荧光素酶报告基因试验对miR499及其靶基因SOX6在鸡快肌和慢肌的表达量和靶向结合关系进行检测。结果发现，在43种脊椎动物中查询到75条miR499基因家族序列，主要位于MYH7B基因内含子区，且具有较高的保守性。进化分析表明，miR499序列进化中符合物种进化演变的规律。靶基因功能富集发现，miR499与组织发育和能量代谢等过程有关。荧光定量检测结果显示，miR499在鸡慢肌中表达量显著高于快肌（P<0.05），与SOX6的表达规律相反。双荧光素酶报告基因试验发现，SOX6的表达能够被miR4995p靶向抑制，提示miR499可能通过SOX6基因参与肌纤维类型调控。

关键词：鸡；miR-499；分子进化；肌纤维类型

基金资助：江苏省自然科学基金面上项目（BK20211121）；现代农业产业技术体系建设专项资金（CARS-41）；江苏现代农业（肉鸡）产业技术体系集成创新中心（JATS［2020］356）