贵州杂交黄牛MSTN基因cDNA克隆、生物信息学及多态性分析

来源：家畜生态学报杂志2023年第4期北京时间：

作者：王可人,游绍航,主性,田兴贵

单位：1.贵州大学 动物科学学院，贵州 贵阳 5500252.铜仁市万山区农业农村局，贵州 铜仁 554200

摘要：为比较贵州杂交黄牛肌肉生长抑制素（Myostatin，MSTN）性质、结构和多态性与本地黄牛的差别，该研究先通过RTPCR克隆MSTN基因cDNA并进行生物信息学分析，再通过PCRSSCP结合直接测序法筛查贵州本地黄牛和杂交黄牛MSTN基因外显子多态性。结果在贵州杂交黄牛MSTN基因CDS区序列发现4个突变位点，其中3个为错义突变：76 bp处G/A替换，引起天冬酰胺变为天冬氨酸；79 bp处G/A替换，引起丝氨酸变为甘氨酸；1 066 bp处G/A替换，引起谷氨酸变为赖氨酸。267 bp处G/A替换与525 bp处A/G替换，为同义突变。MSTN蛋白基本理化性质和结构与普通牛基本一致，但有细微的差别；通过基因同源性和系统进化树，结合motif、蛋白保守域和结构域分析，可知MSTN基因在哺乳动物中高度保守，但也存在遗传多样性。贵州本地黄牛外显子发现3个SNP位点，分别为g.6279107 G>C、g.6281238 T>C和g.6283933 A>C，贵州杂交黄牛中未发现多态位点。单倍型分析共发现6种单倍型和14种双倍型，双倍型H3H5频率最高，且杂交牛的双倍型均为H3H5，之后可一步将此与生长性状进行关联分析研究。

关键词：贵州杂交黄牛；肌肉生长抑制素基因；基因克隆；生物信息学；多态位点

基金资助：贵州本地黄牛MSTN基因多态性与生长性能分析（贵大人基合字（2017）20号）；贵州省科技创新人才团队项目（黔科合平台人才20195615）