基于基因组芯片技术筛选西门塔尔牛优质性状的分子标记
来源：家畜生态学报杂志2023年第6期北京时间：
作者：张成龙,岳成广,刘春洁,郑浪漫,常倩倩,何婉钰,张璐璐,高庆华,刘书东
单位：1. 塔里木大学 动物科学与技术学院， 新疆维吾尔自治区 阿拉尔市843300；2. 新疆生产建设兵团塔里木畜牧科技重点实验室，新疆维吾尔自治区 阿拉尔市 843300
摘要：该研究旨在探索西门塔尔牛优质性状相关的分子标记，解析肉乳兼用性状的遗传规律。基于西门塔尔牛、荷斯坦奶牛、鲁西黄牛和秦川牛的基因组芯片，使用PCA（Principal component analysis）、进化树、Admixture方法来检测遗传多样性和种群结构；使用FST（Fixation index）和BayesCan方法检测选择信号，基于牛参考基因组ARS-UCD1.2对结果前1%的SNPs进行注释。结果显示，4个牛品种在遗传结构上能够进行很好的区分，但西门塔尔牛和荷斯坦牛亲缘关系更近，与中国本土牛品种的亲缘关系较远。西门塔尔牛与荷斯坦奶牛品种的差异主要表现为毛色和乳腺发育；与中国本土牛品种的差异主要表现在乳腺发生、脂肪沉积等生物学特征。本文在基因组水平上解析了西门塔尔牛主要优质性状的遗传特征，为我国引入品种牛的遗传评估和分子育种提供参考。
关键词：西门塔尔牛；选择信号；BayesCan；遗传结构
基金资助：西门塔尔（安格斯）牛群体改良提升计划项目(20202025);国家大学生创新创业项目（202110757017）
