猪PFN1基因在骨骼肌组织中的表达模式及多态性研究

来源：家畜生态学报杂志2023年第11期北京时间：

作者：李新荻,王宇,卢鸿,罗布白珍,何辰庆,段梦琪,叶幼荣,张健,商鹏

单位：1. 西藏农牧学院动物科学学院，西藏 林芝 860000；2. 西藏特色农牧资源研发省部共建协同创新中心，西藏 林芝 860000；3. 林芝市巴宜区畜牧兽医总站，西藏 林芝 860000

摘要：为探究猪前纤维蛋白1（Profilin-1，PFN1）基因多态性及其在猪骨骼肌组织中的mRNA表达规律，以藏猪（Tibet pigs,TP）和大约克猪（Yorkshire pigs,YP）作为试验动物，采用Sanger测序技术对PFN1基因CDS区、5'UTR启动子区进行单核苷酸多态性（Single nucleotide polymorphism，SNP）的筛选与基因分型，预测分析了PFN1基因的SNPs位点突变前后转录因子的功能特性；采用RT-qPCR技术检测PFN1基因在30、90、180日龄三个时期TP和YP的腿肌与背最长肌中的mRNA表达量。结果表明：PFN1基因启动子区域存在三个SNPs,且TP与YP基因频率差异显著；产生了8个新增转录因子结合位点，这些位点调控骨骼肌生长发育、细胞形态建成和保持等过程；PFN1基因表达水平于30日龄时最高，随日龄的增加而下降，90、180日龄时TP的PFN1基因表达量均显著（P<0.05）或极显著（P<0.01）低于YP。综上表明，猪PFN1基因SNPs位点多态性与骨骼肌mRNA的差异表达相关，推测PFN1基因对猪早期骨骼肌生长发育与肌纤维细胞形态保持起重要的调控作用，本研究结果为后续进一步探索其分子作用机制奠定基础。

关键词：藏猪；PFN1基因；单核苷酸多态性；骨骼肌；mRNA表达

基金资助：西藏自治区重大科技专项项目（XZ202101ZD0005N）；中国农业大学基本科研业务费专项资金项目（2021TC002）；四川省区域创新合作项目（2020YFQ0029）；中央引导地方项目（YDZX20195400004426）