略阳乌鸡和镇坪乌鸡的群体结构及遗传多样性分析

来源：家畜生态学报杂志2024年第7期北京时间：

作者：刘振宇,龚冕,王菲,徐乃一,王哲鹏,姜雨

单位：1. 西北农林科技大学 动物科技学院,陕西 杨凌 712100;2. 西南大学 动物科学技术学院,重庆 北碚区 400715

摘要：略阳乌鸡和镇坪乌鸡是陕西省特有乌鸡群体，乌鸡肉营养丰富，深受消费者喜爱，具有巨大的经济价值。然而，至今尚未有研究系统阐明这两群体基因组特征。该研究采集20只略阳乌鸡、20只镇坪乌鸡样本进行全基因组重测序，并结合110只鸡公开数据构建SNP集合。通过群体结构分析发现中国地方鸡的聚类模式有明显的地理趋势，略阳乌鸡和镇坪乌鸡之间的遗传距离最近，表现出南北方家鸡遗传成分的混合。遗传多样性分析显示两乌鸡群体具有较高的观测杂合度、较快的连锁不平衡衰减以及较低的近交系数，遗传多样性较高。该研究加深了对陕西地方乌鸡群体遗传结构和多样性的认识，对略阳乌鸡和镇坪乌鸡种质资源保护具有一定参考意义。

关键词：略阳乌鸡；镇坪乌鸡；群体结构；遗传多样性

基金资助：陕西省自然科学基础研究计划项目（2022JQ-171）；陕西省博士后科研项目（2023BSHYDZZ86）；陕西省农业农村厅基金项目（K3031222078，K3031222097）