《家畜生态学报杂志》发表论文赏析

不同藏羊群体ASIP基因SNP位点筛选及其遗传分析

来源:家畜生态学报杂志2024年第10期北京时间:

作者:张耀,王啟婷,张存芳,多杰才旦,蔡伟杰,郝佳慧,覃敏欣

单位:1.青海大学 省部共建三江源生态与高原农牧业国家重点实验室,青海 西宁 810016;2.青海大学 农牧学院,青海 西宁 810016;3.湟源县畜牧兽医站,青海 湟源 812199;4.海南州动物疫病预防控制中心,青海 共和 813099

摘要:藏羊产于青藏高原及其毗邻地区,外部特征非常突出,杂色藏羊约占总群体的90%,被毛纯白和纯黑个体很少。为研究ASIP基因的SNPs多态性与藏羊毛色遗传之间的关系,本研究采用混池测序及PCR-SSCP法对ASIP基因7个外显子在高原型、欧拉型、扎什加型和黑藏羊4种类型藏羊群体中的突变位点进行了检测。结果共发现5个位点存在突变,分别为外显子3 g.49396C>G和外显子7的g.76594G>C、g.76715T>A、g.76732C>G和g.76811C>A。其中突变位点g.76715T>A碱基颠换引起第126位的半胱氨酸转变为丝氨酸(C126S)。而突变位点g.49396C>G在4个藏羊类型中都存在CC、CG、GG 3种基因型,该突变位点在高原型、欧拉型、扎什加型和黑藏羊群体中的最小突变概率分别为0.416、0.234、0.261、0.307,多态信息含量分别为0.485、0.358、0.386、0.424,都为中度多态。除欧拉型藏羊外,高原型、黑藏羊、扎什加型3个群体处于Hardy-Weinberg平衡状态。研究结果显示,ASIP基因g.49396C>G和g.76715T>A错义突变应是调控藏羊毛色遗传的重要位点,可为藏羊毛色的选育提供潜在的遗传标记。

关键词:藏羊;ASIP基因;SNP;遗传多样性

基金资助:青海省应用基础研究项目(2021-ZJ-728)

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