荷斯坦牛与娟姗牛选择信号差异分析

来源：家畜生态学报杂志2025年第2期北京时间：

作者：孙一斐,白凤庭,郭应威,窦鸣乐,代学雷,李鑫妹,王喜宏

单位：西北农林科技大学 动物科技学院，陕西 杨凌 712100

摘要：为研究荷斯坦牛与娟姗牛的选择信号特征，解释其表型差异的分子机理，对不同国家的220头荷斯坦牛、娟姗牛的重测序数据，用多个欧洲兼用及肉用品种为对照，通过CLR、FST、π-ratio检测荷斯坦牛与娟姗牛显著选择信号。结果表明：（1）筛选到荷斯坦牛257个候选基因，4号染色体76.90~76.95 Mb受到高度选择，该区域包含的NPC1L1、NUDCD3基因与泌乳性状有关，NPC1L1中存在3个错义突变，p.E732K和p.Y888C两个错义突变高度保守，p.V683M和p.E732K两个错义突变位于NPC1L1蛋白质跨膜结构域，改变了氨基酸的理化性质。（2）娟姗牛7号染色体43.40~43.47Mb受到强烈选择，该区域包含与耐热（MED16）、免疫（PRTN3、AZU1、ELANE）有关的基因。研究结果显示，荷斯坦牛NPC1L1、NUDCD3基因与泌乳性状有关；娟姗牛MED16与PRTN3、AZU1、ELANE基因 分别与免疫和耐热有关。

关键词：荷斯坦牛；娟姗牛；泌乳；免疫；选择信号

基金资助：国家重点研发计划（2022YFF1000100）；宁夏自治区重点研发重大项目（2021BEF01001）