《家畜生态学报杂志》发表论文赏析

2株新型鸭呼肠孤病毒的分离鉴定及全基因组遗传进化分析

来源:家畜生态学报杂志2025年第3期北京时间:

作者:李长乐,姚鑫炎,王明月,肖毅,张雪莲

单位:1. 德州市农业农村局,山东 德州 253000;2.佛山科学技术学院 生命科学与工程学院,广东 佛山 528231

摘要:为了解广东地区鸭呼肠孤病毒的序列信息,对广东省佛山市和肇庆市疑似呼肠孤病毒感染的病鸭进行检测、分离、鉴定及全基因组测序分析。通过对疑似样本进行剖检发现,病鸭肝脏呈现不规则出血斑块,脾脏和法氏囊出现严重出血、坏死。使用实验室建立好的检测方法对其进行检测,并利用LMH细胞对新型鸭呼肠孤病毒(Novel Duck reovirus,NDRV)进行分离,同时对分离的毒株进行全基因测序及分析。结果显示,在第3代的LMH细胞上出现典型的细胞病变,经检测确定为NDRV。全长扩增显示,所分离的2株NDRV全长均为23 419 bp,可分为10个片段,分别为L1~L3、M1~M3和S1~S4。核苷酸同源性与氨基酸同源性分析显示,与国内的NDRV同源性最高,与番鸭呼肠孤病毒(Muscovy Duck reovirus,MDRV)和禽呼肠孤病毒(Avain revirus,ARV)同源性较低。遗传进化关系显示,所分离的2株毒株的10个片段均分布于NDRV大分支,由此表明,分离的2株毒株均为NDRV。该研究丰富了NDRV的序列信息,为广东地区NDRV的防控及特异性生物制品的研究提供了参考依据。

关键词:新型鸭呼肠孤病毒;分离鉴定;全基因组测序;遗传进化分析

基金资助:广东省基础与应用基础研究基金(2022A1515012194);广东省基础与应用基础研究区域联合基金-青年基金项目(2019A1515110157);广东省教育厅普通高校重点领域专项(乡村振兴)(2020ZDZX1004);广东省水禽产业技术体系创新团队(2023KJ137)

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