青海湖裸鲤锚头鳋线粒体基因组测定及分析

来源：家畜生态学报杂志2025年第4期北京时间：

作者：潘丽丽,李长忠,李昭楠,陈艳霞,王国杰,金文杰

单位：1. 青海大学 生态环境工程学院，青海 西宁 810016；2. 青海省渔业技术推广中心，青海 西宁 810012

摘要：为了对寄生于青海湖祼鲤中的锚头鳋线粒体基因组序列特征进行全面解析，该研究从人工养殖的青海湖裸鲤病鱼中分离获得锚头鳋虫体样品2.5 g，提取基因组DNA，通过Illumina测序技术对锚头鳋mtDNA进行测序、组装和注释，并进行生物信息学分析；采取最大似然法（maximum likelihood，ML）利用25个桡足类物种的线粒体基因组序列与此研究测得锚头鳋基因序列构建系统发育树。锚头鳋线粒体基因组长度为14 591 bp（GenBank登录号：ON943063.1），34.86% A、35.86% T、12.33% G及16.72% C，具有明显的AT偏向性（70.73%），包括22个tRNA基因、13个蛋白质编码基因、2个rRNA基因和2段非编码区（AT-loop区）。13个蛋白编码基因的起始密码子均为ATN，除nad5、nad4l和cox3基因的终止密码子为不完全终止密码子T，其他基因的终止密码子均为TAA或TAG；2个rRNA基因总长度为1 451 bp，12个基因能形成典型的三叶草结构，其余10个基因缺失DHU臂、TΨC臂和TΨC环而不能形成三叶草结构；两段非编码区在环状的DNA分子中一段位于trnI-atc和trnH-cac之间，一段位于rrnS和trnS1-aga之间。系统发育树结果显示，测序所得锚头鳋在进化上与鲤锚头鳋（L. cyprinacea）（KM235194.1和NC_025139.1）和矮小拟镖剑水蚤（Paracyclopina nana）（EU877959.1）聚为一个进化分支。该研究结果可为锚头鳋早期分子学诊断和快速检测提供理论数据。

关键词：线粒体基因组；桡足亚纲；锚头鳋；系统发育分析

基金资助：青海省重大科技专项（2019-NK-A2）