《家畜生态学报杂志》发表论文赏析

HBP1促进鸡前脂肪细胞增殖的可变剪接事件的分析与鉴定

来源:家畜生态学报杂志2025年第9期北京时间:

作者:邹梦倩,樊思洋,金泽文慧,刘邦华,陈洪艳

单位:1. 齐齐哈尔大学 生命科学与农林学院,黑龙江 齐齐哈尔 161006;2. 齐齐哈尔大学 后勤管理处,黑龙江 齐齐哈尔 161006

摘要:HMG盒转录因子 1(HMG-box transcription factor 1,HBP1)是一种普遍存在的转录调节因子,前期研究表明,HBP1基因是鸡前脂肪细胞增殖的正调控因子,通过促进鸡前脂肪细胞增殖在脂肪组织生长发育过程中发挥关键作用。但其促进鸡前脂肪细胞增殖的分子调控机制尚不清楚。可变剪接(alternative splicing,AS)增加了转录组的多样性,是调节基因表达和产生蛋白质组多样性的重要机制。为探究鸡前脂肪细胞增殖过程中的可变剪接事件,本研究以永生化鸡前脂肪细胞为试验材料,利用慢病毒方法成功建立了稳定过表达HA-HBP1融合蛋白的鸡前脂肪细胞系(命名为HBLV-HA-HBP1)和慢病毒对照细胞系(命名为HBLV-HA),随后应用过表达HBP1增殖48 h的鸡前脂肪细胞和对照细胞的RNA-seq,挖掘出鸡前脂肪细胞增殖过程中发生的可变剪接事件、基因和信号通路。结果显示,6个样品中共鉴定出28 792个可变剪接事件,涉及7 547个基因,可变剪接类型依次为外显子跳跃、外显子互斥、3'位点可变前接、内含子保留和5'位点可变剪接;可变剪接的基因主要富集在Wnt等与增殖相关的信号通路;CHEK1、DLG1和PHF20等基因可能在调节前脂肪细胞增殖过程中具有重要作用。本研究鉴定了HBP1诱导鸡前脂肪细胞增殖过程中的可变剪接事件和基因,为家禽育种提供了新思路。

关键词:可变剪接;HBP1;鸡;前脂肪细胞;增殖

基金资助:黑龙江省省属高等学校基本科研业务费科研项目(145209218);黑龙江省省属本科高校优秀青年教师基础研究支持计划(YQJH2024273)

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