鸡白痢沙门菌sRNA的预测及毒力相关sRNA的筛选

来源：家畜生态学报杂志2025年第10期北京时间：

作者：何婷,冉旭华,丁永辉,孙羽伶,李天森

单位：海南大学 热带农林学院，海南 海口 570228

摘要：为预测鸡白痢沙门菌中存在的非编码sRNA，筛选与细菌存活及致病相关的sRNA，该试验利用small RNA-seq（sRNA-seq）技术对鸡白痢沙门菌进行测序，选取具有代表性的sRNA进行生物信息学分析及其靶基因预测，通过RT-PCR对候选sRNA进行验证，最终在鸡巨噬细胞HD11感染模型中检测候选sRNA转录水平情况。结果显示：sRNA-seq得到111条新预测的sRNA，筛选出7条Reads数最高的sRNA；二级结构预测显示7条sRNA均有典型的茎环结构；靶基因KEGG和GO富集分析表明候选sRNA涉及跨膜转运和细菌代谢等多项生理过程；RT-PCR结果显示，候选sRNA中有5条检测到转录水平；细胞感染模型试验结果显示，sRNA12最有可能参与细菌感染及致病过程。该研究发现了鸡白痢沙门菌的新的sRNA，同时筛选出可能参与细菌生存和致病过程的sRNA，为深入探究鸡白痢沙门菌的致病机制及潜在抑菌靶点提供科学依据。

关键词：鸡白痢沙门菌；非编码小RNA；靶基因预测；胞内生存

基金资助：海南省自然科学基金高层次人才项目（823RC468）；国家自然科学地区基金项目（32360878）；海南省自然科学基金（321RC1020）；海南省研究生创新科研课题(Qhys2023-229)