《家畜生态学报杂志》发表论文赏析
作者:张冬杰,汪亮,马守正,刘娣
单位:黑龙江省农业科学院 畜牧研究所,哈尔滨 150086
摘要:为了探讨民猪遭受冷应激后肝脏全转录组基因表达谱的变化,该研究以6头180日龄健康状况良好、体重相近(约55 kg)的雌性民猪为试验材料,随机分为2组,每组3头。将其中一组设为对照组,在18±3 ℃的舍内饲养,另一组设为试验组,在舍外半敞篷内饲养,全天温度在-15~-24 ℃之间。3 d后,6头试验猪同时屠宰,取肝脏组织进行全转录组测序分析,包括对mRNA、lncRNA和circRNA的鉴定及功能分析。结果表明:冷应激后,民猪肝脏内大量基因的转录水平发生了显著变化,371个mRNA、82个lncRNA和34个circRNA显著上调(P<0.05);633个mRNA、76个lncRNA和33个circRNA显著下调(P<0.05);针对表达差异的mRNA、lncRNA的靶基因以及circRNA的来源基因进行GO功能注释及Pathway富集分析,发现冷应激下,肝脏内的脂肪沉积、氨基酸代谢、细胞外基质与细胞表面受体之间的相互作用通路、氧化磷酸化过程等发生了显著变化。由此可知,冷应激下,民猪肝脏组织与能量代谢、信号转导等相关通路被激活,作为基因转录组重要组成部分的mRNA、lncRNA和circRNA表达发生变化,它们在民猪抵抗冷应激过程中发挥重要作用。
关键词:冷应激;民猪;肝脏;转录图谱;富集分析
基金资助:国家自然科学基金项目(32172696);国创中心先导项目(NCTIP-XD/B01);黑龙江省农科院创新工程重大项目(CX23ZD06)