《家畜生态学报杂志》发表论文赏析
作者:张亚琴,甘宗辉,邱潇,倪黎纲,徐盼
单位:1. 江苏农牧科技职业学院,江苏 泰州 225300;2. 山东省枣庄市山亭区畜牧兽医服务中心,山东 枣庄 277200;3. 江苏省兴化市畜牧兽医站,江苏 泰州 225300
摘要:为探索不同阶段苏姜猪肉质的转录组差异及相关差异基因的数据信息,选用1月龄和8月龄苏姜猪各3头,对其背最长肌进行转录组测序分析,鉴定出差异表达基因(DEGs),并对其进行GO功能注释和KEGG富集分析。结果显示,1月龄和8月龄苏姜猪背最长肌中有1493个差异表达基因,其中表达上调基因674个,表达下调基因819个。富集分析结果显示这些差异表达基因主要显著富集于细胞过程、生物调控和生物过程的调节等生物学过程,大多数差异基因参与环境信息过程。基于多种算法得到关键基因分别是: MYH3、ADAMTS2、SPARC、COL1A2、COL21A1和COL2A1,为深入研究苏姜猪肉质性状的分子机理奠定基础。
关键词:苏姜猪;背最长肌;转录组测序;候选基因
基金资助:江苏省种业振兴项目(JBGS〔2021〕024);江苏现代农业产业技术体系建设专项资金(JATS[2023]352);江苏高校“青蓝工程”;江苏农牧科技职业学院校级科研揭榜挂帅项目(NSF2024JB02)