《家畜生态学报杂志》发表论文赏析
作者:侯金星,任庆,张建永,卜佳琦,安小鹏
单位:1. 陕西农林职业技术大学 动物工程分院,陕西 杨凌 712100;2. 淳化县农业农村局车坞镇农业技术推广区域站,陕西 咸阳 712000;3. 乾县动物疫病预防控制中心,陕西 咸阳 712000;4. 西北农林科技大学 动物科技学院,陕西 杨凌 712100
摘要:为克隆关中奶山羊嘌呤富集元素结合蛋白B(PURB)基因CDS区,开展生物信息学分析,检测PURB基因组织表达谱,初步探究PURB基因在关中奶山羊乳腺发育中发挥的功能。本研究以关中奶山羊乳腺组织cDNA为模板,通过PCR技术克隆PURB基因CDS区并测序,结合生物信息学方法分析其序列特征,采用实时荧光定量PCR检测PURB基因在关中奶山羊乳腺、子宫、心脏、肾脏、脾脏、肝脏组织中的表达水平。结果表明:成功克隆的关中奶山羊PURB基因CDS区序列全长915 bp,编码304个氨基酸;氨基酸相似性比对表明,PURB基因氨基酸序列在不同物种间非常保守,系统进化树显示山羊与绵羊、牛的亲缘关系更近,与马和单峰骆驼较远。PURB蛋白分子式为C1426H2228N420O454S5,为不含信号肽的非跨膜亲水性蛋白,含有21个潜在磷酸化位点,主要存在于细胞质。关中奶山羊PURB蛋白的二级结构主要由β-折叠、α-螺旋和无规则卷曲组成,三级结构预测结果与二级结构一致。PURB基因呈组织特异性表达,在子宫和脾脏中的表达量显著高于其他组织(P<0.05),而在心脏中几乎不表达。本研究成功获得关中奶山羊PURB基因CDS区,并探究了PURB基因的生物信息学功能及组织表达特征,为进一步研究关中奶山羊PURB基因功能提供了参考。
关键词:奶山羊;PURB;基因克隆;组织表达谱;生物信息学分析
基金资助:杨凌职业技术学院院内基金项目(BG2022005);杨凌示范区工委组织部青年育种专家支持计划项目(杨组发[2022]37号);陕西省重点研发计划项目(2024NC-ZDCYL-03-01,2024NC-YBXM-082,2024NC-GJHX-22,2025CY-JJQ-201);西安市科技计划项目(25NJSZD00009)