《疾病监测杂志》发表论文赏析
作者:徐良彩,李玲玲,许玉成,张勇,刘松,吴双,郭聪锐,朱启诚,梁肇海
摘要:目的解析2024年广东省深圳市一起幼儿园百日咳聚集性疫情的病原学特征及进化溯源。方法收集百日咳鲍特菌核酸阳性样本进行菌株分离培养和药敏实验,采用全基因组测序分析分离株的分子特征,结合国内552株百日咳鲍特菌分离株和203株大环内酯耐药MT28基因型(macrolide-resistance MT28 genotype, MR-MT28)克隆群菌株基因组数据,开展分子溯源与遗传进化分析。结果本次调查成功分离3株百日咳鲍特菌,均属于MR-MT28克隆群,且高度同源单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphisms, SNP)差异个数≤1,与上海市2021-2024年分离株(8株)的遗传同源性高(4个SNP),但病例均无外地旅居史。 ptxP3谱系在我国分离株中的占比从2015年的9.93%升至2020-2024年的82.76%。 与疫苗株Tohama I / CS相比,MR-MT28克隆群存在4个抗原位点漂移(ptxP3、ptxA1、ptxC4、prn150)。结论本研究证实暴发疫情是由百日咳鲍特菌MR-MT28克隆群在深圳市的本地传播引起,提示我国其他地区警惕该菌的跨区域扩散风险,建议加强基于全基因组测序的百日咳病原学监测网络建设,动态监测和评估抗原漂移对细菌耐药和疫苗保护免疫逃逸产生的潜在影响。
关键词:百日咳鲍特菌, 全基因组测序, 大环内酯耐药MT28基因型克隆群, 抗原漂移, 分子流行病学