2018－2020年甘肃省腹泻病毒流行特征及A组轮状病毒全基因组特征

来源：疾病监测杂志2023年第2期北京时间：

作者：康倩,吕彩霞,王雪莹,汪鹏,张慧敏,于德山,李丹地

摘要：目的 了解2018—2020年甘肃省A组轮状病毒（RVA）流行特征及全基因组特征。方法 选取甘肃省腹泻症候群监测的6家哨点医院采集的腹泻患者粪便2553份，经实时聚合酶链式反应检测A组轮状病毒、诺如病毒、腺病毒、星状病毒、札如病毒核酸，选取部分轮状病毒阳性样本构建DNA测序文库，采用第二代测序，并进行分析。结果 共检出病毒阳性标本853份，检出率33.41%，其中轮状病毒阳性率最高（17.43%），其次是诺如病毒（12.65%）、腺病毒（6.58%）、星状病毒（4.70%）、札如病毒（1.02%）。 对50份轮状病毒阳性标本进行第二代测序，获得31株全序列，其中24株G9P［8］、2株G2P［8］、3株G2P［4］、1株G9P［6］ 和1株G9P［4］型别。 全基因组核苷酸序列分析发现，除VP7片段外，序列差异比较大的有VP3和NSP4两个节段。 本研究获得21株G9P［8］型Wa-like株(G9-P［8］-I1-R1-C1-M 1-A1-N1-T1-E1-H1)，3株NSP4节段重配的G9P［8］-E2株(G9-P［8］-I1-R1-C1-M1-A1-N1-T1-E2-H1)，在测序的24株G9P［8］型RVA毒株中，G9P［8］-E2重配株占12.5%（3/24）。 结论 2018—2020年甘肃省轮状病毒是儿童腹泻的主要病原体，以G9P［8］ 基因型为绝对优势，首次发现G9P［8］-E2重配株，应持续进行病毒变异的监测。

关键词：A组轮状病毒, 基因重配, 第二代测序, G9P［8］