斯氏弓形杆菌基于基因组序列遗传特征分析

来源：疾病监测杂志2021年第1期北京时间：

作者：周贵兰,王园园,顾一心,李颖,鞠长燕,王佳奇,王海瑞,陈晓丽,段永翔,张茂俊

摘要：目的 获得斯氏弓形杆菌的遗传特征，并对其耐药基因及毒力相关基因进行预测分析。方法 对本实验室分离培养的8株斯氏弓形杆菌进行基因组测序并从NCBI和PATRIC数据库中下载全部已完成基因组测序的15株斯氏弓形杆菌的全基因组序列，应用生物信息学软件对23株不同地域、不同宿主来源的斯氏弓形杆菌进行遗传特征分析。结果 23株斯氏弓形杆菌中仅3株菌携带耐药基因，且均为β-内酰胺类抗生素耐药基因。 所有菌株均含有与免疫逃避、侵袭及运动等相关的毒力基因。 与其他菌种弓形杆菌常见的10种毒力基因比对分析发现，本研究中所有斯氏弓形杆菌菌株均含有ciaB、tlyA、cj1349、pldA和mviN基因，2株菌（CNAS12-1和F28）含有iroE基因，均不携带另外4种毒力基因。 21.7%（5/23）的菌株包含Ⅵ型分泌系统（T6SS）基因簇，且其与弯曲菌属内的T6SS存在基因组成及排列的差异。结论 斯氏弓形杆菌有较高的遗传多样性，部分菌株可能有潜在的耐药和致病特征。

关键词：斯氏弓形杆菌, 耐药基因, 毒力基因, Ⅵ型分泌系统, 种群结构特征