麦氏弧菌多位点序列分型方法的建立与应用

来源：疾病监测杂志2020年第1期北京时间：

作者：黄振洲,于可艺,代航,蔡红艳,徐潇,王多春

摘要：目的建立针对麦氏弧菌的多位点序列分型（MLST）方法，评价该方法的分型效果，并对收集的麦氏弧菌进行MLST分析。方法筛选出7个管家基因（ftsZ、gapA、mreB、gyrB、purM、recA、ropA），设计特异引物，在17株麦氏弧菌中PCR扩增管家基因序列。 用DnaSP 6.12.03软件和Split tree 4.0软件评价基因多态性、中性进化和基因重组情况；根据7个管家基因的序列差异获得对应的序列分型（ST）型别，用BioNumerics 7.1软件对不同ST型别构建最小生成树和聚类图，并用eBURST 3.0软件计算克隆复合体（CCs）。结果所选的管家基因具有足够多的等位基因位点、序列差异和足够高的分辨率；7个管家基因的Split tree对所有麦氏弧菌的聚类一致；中性试验结果显示，7个管家基因在进化过程中受遗传漂变的影响较小。 MLST将17株麦氏弧菌分成14个ST型别，大多数菌株（64.70%）均单独形成一个ST型别，其中ST007形成了可能的优势克隆群。 这些菌株之间存在相对较远的遗传距离，在垂直传播上呈现出潜在的地域聚集性。结论本研究建立的麦氏弧菌的MLST方法能分析麦氏弧菌的种群结构和遗传进化关系。

关键词：麦氏弧菌, 多位点序列分型, 管家基因, 序列型