《疾病监测杂志》发表论文赏析

2017年辽宁省人感染汉坦病毒G2片段基因序列特征分析

来源:疾病监测杂志2018年第12期北京时间:

作者:车雷,张国斌,高丹,赵梁,王晓丽

摘要:目的了解2017年辽宁省肾综合征出血热(HFRS)患者感染汉坦病毒的(HV)的基因型别及变异情况。方法采集HFRS患者急性期血清,采用酶联免疫吸附试验筛选IgM抗体阳性标本,从阳性标本全血中提取HV的RNA,通过反转录聚合酶链式反应(RT-PCR)扩增G2基因片段并进行基因分型,对扩增产物进行核苷酸序列测定,利用DNAStar软件包分析。结果10份标本经RT-PCR提取扩增出的目的片段,4份为汉滩型(HTN型),6份为汉城型(SEO型)。 扩增产物测序结果与已测得国内毒株及部分国际标准株比较,4份HTN型HV之间核苷酸同源性达到95.6% ~ 98.9%。 与HTN76–118株同源性最高,为89.3% ~ 90.1%,氨基酸同源性为98.4% ~ 99.2%。 6份SEO型HV间核苷酸同源性高达98.3% ~ 99.8%。 与80–39株同源性最高,为96.3% ~ 96.6%,推导氨基酸同源性为99.3% ~ 99.6%。结论辽宁省是以SEO型HV为主的SEO型和HTN型混合型疫区,病毒G2基因片段间高度同源,无明显变异,遗传物质相对稳定。

关键词:汉坦病毒, G2片段, 系统进化树, 基因变异

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