《疾病监测杂志》发表论文赏析
作者:王建平,杜鹏程,白雪梅,郑翰
摘要:目的分析wzy基因序列与血清分型相关性,评价基于wzy基因的基因组水平血清分型的可行性。方法建立了33个已知血清型(1 ~ 31,33与1/2型)及21种新型cps型别(NCL1 ~ 20与Chz型)的wzy基因的氨基酸序列数据库,用来检索公开发表的767个有传统血清分型结果的基因组序列,以确定它们的分子血清型别,并与其用传统血清分型结果进行比对。结果767个基因组中,有765个基因组含有1种且仅含有1种数据库中的wzy基因,剩余的2个基因组携带数据库中没有的wzy基因,本研究中将其cps型别命名为NCL21。 94.13%(722/767)基因组的分子血清型别与其传统血清分型结果一致。 在二者结果有差异的基因组中,其cps基因簇的核苷酸序列与其传统血清分型结果相应的血清型标准菌株cps序列有明显的差异。结论基因组水平检测血清型特异性的wzy基因的分型策略,显著优于传统的血清分型方法。
关键词:猪链球菌, <i>wzy</i>基因, 基因组, 血清分型