海南省类鼻疽临床分离株核糖体16S-23S内转录间隔区序列多态性分析

来源：疾病监测杂志2017年第6期北京时间：

作者：贺金荣,朱雄,李沙,陈海,吴华,夏连续,李伟,郑霄

摘要：目的 研究海南省类鼻疽伯克霍尔德菌核糖体16S-23S内转录间隔区（ITS）序列多态性及基因型特征，了解该省与其他类鼻疽流行区菌株间的遗传背景差异。方法 PCR扩增272株类鼻疽伯克菌的ITS片段并通过毛细管凝胶电泳检测产物长度；通过DNA测序及序列比对确认不同长度ITS的基因型及序列一致性；通过2检验分析不同流行区ITS型别的分布差异。结果 经毛细管凝胶电泳及DNA测序确认，272株类鼻疽伯克菌中发现C、E、CE、G 4种ITS基因型：C型64株（23.53%），E型144株（52.94%），CE型56株（20.59%），G型8株（2.94%）。序列比对证实，海南省类鼻疽伯克菌中各型别（C、E、G）ITS序列高度保守，不同型别ITS的长度变化由其主要变异区的序列差异引起。我国海南省与泰国流行区的ITS型别分布差异有统计学意义（2=8.296，P0.05），与澳大利亚流行区分布差异无统计学意义（2=5.521，P0.05）。结论 海南省类鼻疽伯克菌临床菌株中存在C、E、CE、G 4种ITS基因型，C、E、CE为优势型别；与泰国、澳大利亚等传统流行区相比，其G型菌株比例较高。

关键词：类鼻疽伯克霍尔德菌, 16S-23S内转录间隔区, 遗传学特征