广东省肇庆市2014-2015年登革病毒分子分型及初步溯源研究

来源：疾病监测杂志2016年第12期北京时间：

作者：谭翰清,谭海芳,朱颖梅,程洁萍,苏乐斌,林凤,邓廷国,黄强,黎碧坚

摘要：目的 了解广东省肇庆市2014-2015年登革病毒（DENV）的基因型别和可能的输入来源。方法 收集登革热临床诊断病例急性期血清，对实时荧光反转录-聚合酶链反应（RT-PCR）检测阳性标本进行病毒培养，分离株进行E基因扩增与序列测定，用Mega 5.1软件进行分子分型和系统进化树构建。结果 409份样品中147份实时荧光RT-PCR检测阳性（35.94%），其中2014年阳性144份（39.99%），以DENV 1（139/361）为主；2015年阳性3份（6.25%），以DENV 3（2/48）为主。共获得22株DENV分离株，其中20株为2014年DENV 1型的genotype Ⅰ和Ⅲ，与2013-2014年广州、佛山市分离株核苷酸同源性分别为99.40%~100.00%和99.20%~100.00%，与新加坡、泰国、马来西亚和印度尼西亚分离株亲缘关系次之；2株为2015年DENV 3的genotype Ⅲ，与近年新加坡和印度尼西亚分离株的核苷酸同源性为98.20%~99.70%。结论 广东省肇庆市2014年暴发流行的DENV 1为genotype Ⅰ和Ⅲ，可能由广州市和佛山市输入，2015年散发的DENV 3为genotype Ⅲ，由佛山市输入，疫情毒株可能源于新加坡、印度尼西亚等东南亚流行株。

关键词：登革病毒, E基因, 实时荧光RT-PCR, 序列分析