副溶血弧菌分子分型数据库建立与分析

来源：疾病监测杂志2016年第11期北京时间：

作者：赵宏群,刁保卫,杜小莉,卢昕,崔志刚,阚飙,逄波

摘要：目的 对我国8个省（直辖市）分离的副溶血弧菌使用脉冲场凝胶电泳（PFGE）开展分子分型工作进行回顾性分析；建立副溶血弧菌PFGE分型数据库，分析其特征。方法 对2005-2014年期间分离自8个省（直辖市）的617株副溶血弧菌使用SfiⅠ酶切后进行PFGE实验，使用BioNumerics 5.01软件分析菌株的PFGE图谱并建立副溶血弧菌分子分型数据库。结果 本研究所建立的副溶血弧菌分子分型数据库共包含617条副溶血弧菌的分子分型信息。这些副溶血弧菌的PFGE图谱可以分为360个PFGE型别，按照PulseNet China的规则对这些PFGE型别进行编码。不同PFGE型别的相似系数介于35.8%~99.6%。237株外环境和食品分离菌株有221个PFGE型别，345株患者分离株有127个PFGE型别。相同血清型的副溶血弧菌具有相同或者非常相似的PFGE型别，而不同血清型之间的副溶血弧菌的PFGE型别差异则较大。大流行血清型（如O3：K6和O4：K8）具有多个优势PFGE型别，对于某些血清型，地理位置相近省份分离菌株的PFGE图谱相似性更高。结论 分离自患者菌株的PFGE图谱克隆化程度高，而分离自食品和外环境的菌株，PFGE图谱多态性较大。PFGE在发现病例成簇中能够发挥作用；对于患者相关PFGE图谱成簇的菌株应加强流行病学调查和溯源工作。

关键词：副溶血弧菌, 脉冲场凝胶电泳, 分子分型数据库, 多样性, 暴发调查