肠道病毒71型湖州分离株的遗传进化和重组分析

来源：疾病监测杂志2016年第7期北京时间：

作者：吴晓芳,纪蕾,徐德顺,陈莉萍,沈月华,朱晓娟,查赟峰

摘要：目的 对湖州市肠道病毒71型（EV71）进行基因特征及重组特点分析。方法 对2011-2012年湖州市EV71分离株进行全基因组测序，并与其基因型及A组肠道病毒其他血清型的原型株进行全序列比对，使用Mega 4.0软件绘制系统进化树。然后利用Simplot 3.5.1软件进行相似性分析，对基因重组加以验证。结果 P1区系统进化分析显示，2011-2012年湖州市EV71株属于C4基因型的C4a亚型。P1、P2、P3区的系统进化和相似性分析证实湖州市分离株在非结构蛋白2B编码区存在EV71 C基因型和Cox A16、14、4型间重组。结论 2011-2012年湖州市EV71分离株为C4a亚型，与2004年以来中国大陆优势株流行趋势一致。EV71 C4基因型湖州市株存在型间重组现象。

关键词：肠道病毒71型, 系统进化分析, 重组