GyrB基因在诺卡菌菌种鉴定中的应用研究

来源：疾病监测杂志2016年第6期北京时间：

作者：李路茜,李振军,楼永良

摘要：目的 分析研究gyrB基因对于诺卡菌种水平的鉴定能力。方法 采用特异性引物对14种41株诺卡菌的gyrB基因进行扩增,并对其产物进行测序。从GenBank数据库中下载21株诺卡菌gyrB基因序列,对序列用DNAStar软件计算其相似性。利用Mega 6.06软件,采用邻接法和最大似然法构建诺卡菌菌种系统发育进化树。结果 以gyrB基因构建的系统发育进化树中,不同诺卡菌种能准确地分离成独立的分支,且亲缘关系较近的近缘种也能得到有效分离。诺卡菌种gyrB基因种内相似性为94.2%~100%,种间相似性约为79.2%~97.6%,平均相似性为86.9%。结论 gyrB基因序列分析是一种快速、准确、特异性较高的鉴定方法,能将诺卡菌属的鉴定至种的水平,对于鉴定诺卡菌属近缘种gyrB基因比16S rDNA更具优越性。

关键词：诺卡菌, gyrB基因, 鉴定