《疾病监测杂志》发表论文赏析

卡介苗中PE和PPE家族蛋白B细胞抗原表位多态性研究

来源:疾病监测杂志2016年第4期北京时间:

作者:李马超,刘海灿,赵秀琴,万康林

摘要:目的 了解13株卡介苗(bacille calmette-gurin, BCG)基因组中由PE/PPE基因家族编码的B细胞抗原表位分布情况, 分析其对BCG免疫保护力的潜在影响。方法 从国际免疫表位数据库(Immune Epitope Data base, IEDB)中检索结核分枝杆菌B细胞抗原表位, 与结核分枝杆菌参考菌株H37Rv的蛋白质组进行序列比对, 确定PE/PPE基因家族编码B细胞抗原表位序列;并与13株BCG基因组进行序列比对, 提取表位编码序列, 分析其在BCG中的分布与变异。结果 6个PE/PPE基因家族的基因编码28个B细胞抗原表位, 21个B细胞抗原表位在13株BCG中高度保守, 7个B细胞抗原表位在BCG中发生基因变异, 变异表位分别产生于BCG的不同形成期。结论 PE/PPE基因家族所表达的蛋白大多为细菌表面蛋白, PE/PPE蛋白家族中B细胞抗原表位的变化可能对BCG的保护力产生影响, 应继续开展基于B细胞表位的BCG遗传特征研究。

关键词:卡介苗, 抗原表位, PE/PPE基因家族, 基因组

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