rpoD和gyrA基因对气单胞菌鉴定的比较分析

来源：疾病监测杂志2016年第3期北京时间：

作者：李欣悦,李凤娟,杜鹏程,王瑞白,王多春

摘要：目的 使用rpoD和gyrA基因对气单胞菌进行种水平的鉴定,比较两者分类结果的差异,同时对本研究中187株气单胞菌进行较为准确的种水平的分类。方法 对生化鉴定的187株气单胞菌进行rpoD和gyrA基因聚合酶链反应扩增并测序,将序列与种特异的参考序列一起构建系统发育树。结果 187株菌经rpoD基因鉴定为7个种,经gyrA基因鉴定为9个种,还有一个未定种。两者鉴定最多的3个种一致,即维氏气单胞菌温和生物变种、豚鼠气单胞菌和水族馆气单胞菌。gyrA基因鉴定增加的2个种是异嗜糖气单胞菌和简氏气单胞菌。rpoD和gyrA基因对气单胞菌鉴定一致的有174株(93%),但有13株菌(7%)两者鉴定不一致。结论 rpoD和gyrA基因能够对大部分气单胞菌进行准确一致的分类,对于两者鉴定不一致的菌株,应增加管家基因进行分析。

关键词：气单胞菌, rpoD基因, gyrA基因, 鉴定