人类免疫缺陷病毒HIV-1基因分型方法的初步构建

来源：疾病监测杂志2015年第9期北京时间：

作者：朱端昊,冯长华,路亮,贺凤兰,魏芳芳,张健,倪贤生

摘要：目的 建立一种合理、详尽、可行的HIV-1基因分型方法。方法 采集南昌地区部分男性性接触人群(MSM)人类免疫缺陷病毒(HIV)感染者血浆,测量HIV病毒载量。提取其病毒RNA,设计引物并对HIV的Env区和Gag区进行反转录-聚合酶链反应。对扩增后的cDNA进行测序,比对序列并分别构建Env区和Gag区的分子进化树,确定样本的基因亚型,并分析p V3环氨基酸序列特征。结果 本研究的3例样本中,1例样本的HIV病毒载量为43.9 copies/ml,其余2例均20 copies/ml。3例样本经核酸序列分析,均鉴定为CRF01_AE亚型。结论 此HIV-1基因分型方法合理、详细,可为国内HIV分子流行病学研究提供一些参考。

关键词：艾滋病病毒, 分子流行病学, 基因分型, 方法学, 系统发育学