霍乱弧菌中VSP-Ⅰ岛的分布和变异特征研究

来源：疾病监测杂志2015年第5期北京时间：

作者：杜鹏程,阚飙,王多春

摘要：目的 探讨霍乱第7次大流行基因岛1(VSP-Ⅰ)在霍乱弧菌中的分布和变异特征. 方法 从美国国立生物技术信息中心的GenBank数据库中下载所有霍乱弧菌基因组数据,以霍乱第7次大流行代表菌株N16961的VSP-Ⅰ作为参考序列,筛查所下载霍乱弧菌基因组中的VSP-Ⅰ.使用MUMmer软件进行单核苷酸多态性(SNP)分析,OrthMCL软件进行同源基因分析,BLAST软件进行序列结构变异分析和功能注释. 结果 VSP-Ⅰ广泛存在于霍乱弧菌中,其中霍乱第7次大流行的105株菌株中均携带VSP-Ⅰ,且其序列高度保守;其中94株菌的VSP-Ⅰ完全一致,仅在11株菌中分别存在1~14个SNP位点.而2株非O1非O139群菌株携带VSP-Ⅰ,但和大流行菌株相比,存在插入缺失等序列变异.同时,VSP-Ⅰ有9个共有保守基因, VC0183 虽在所有菌株中均存在,但在2株非O1非O139菌株中长度发生改变.此外,VSP-Ⅰ携带5个与该岛的转移和整合相关的基因(VC0181~VC0185), VC0178 编码马铃薯糖蛋白类似物, VC0180 编码蛋白水解酶,二者可能与毒力相关. 结论 作为霍乱第7次大流行菌株中的特异性基因簇,VSP-Ⅰ已转移至非O1非O139群菌株中,并发生序列的变异.

关键词：霍乱弧菌, VSP-Ⅰ岛, 分布, 变异