2008-2013年浙江省柯萨奇病毒A组16型VP1区基因特征分析

来源：疾病监测杂志2015年第4期北京时间：

作者：葛琼,龚黎明,茅海燕,张严峻,陈寅,李榛

摘要：目的 了解浙江省2008-2013年手足口病(hand foot and mouth disease, HFMD)患者中柯萨奇病毒A组16型(Coxsackievirus A16,Cox A16)的流行株VP1区基因特征. 方法 对浙江省2008-2013年手足口病患者粪便、疱疹液和咽拭子标本中分离到的Cox A16毒株用反转录-聚合酶链反应(reverse transcription polymerase chain reaction,RT-PCR)进行VP1区特异性基因扩增,对扩增产物进行核苷酸序列测定并参考Cox A16的参考毒株和中国其他地区的Cox A16分离毒株进行同源性分析和构建系统发生树. 结果 浙江省2008-2013年的81株Cox A16分离株,其VP1区核苷酸和氨基酸同源性分别是88.7%～100%和97.8%～100%.与原型株G10(G-10/RSA/1951)的VP1区核苷酸和氨基酸同源性分别是61.9%～65.1%和90.1%～91.7%.81株Cox A16分离株全部属于B1基因亚型,有B1a和B1b两个基因亚型. 结论 浙江地区2008-2013年分离到的81株Cox A16分离株属于B1基因亚型,有B1a和B1b两个进化分支共同进化和循环.

关键词：肠道病毒, 手足口病, 柯萨奇病毒A组16型, 基因型