西瓜果斑病菌T2SS分泌蛋白的筛选和功能预测
来源：华中农业大学学报杂志2015年第3期北京时间：
作者：潘宏
摘要：利用KEGG和STRING数据库分析比较瓜类果斑病菌(西瓜嗜酸菌)（Acidovorax citrulli,Ac）和主要植物病原细菌Ⅱ型分泌系统（T2SS）的基因组成,收集有试验证据的植物病原细菌T2SS分泌蛋白序列信息，与已测序并经注释的果斑病菌AAC00-1菌株基因组进行序列比对，筛选出候选的果斑病菌同源T2SS分泌蛋白。通过对筛选出的分泌蛋白的信号肽、代谢通路、蛋白互作网络及其在植物细胞中的定位进行分析，预测部分分泌蛋白的生物学功能。
关键词：细菌性果斑病; 瓜类果斑病菌(西瓜嗜酸菌); 分泌蛋白; 筛选; 功能
基金资助：国家公益性行业（农业）科研专项（201003066）
